Nigdy nie robiłem dużego projektu z masą przejść, z HFX tym bardziej, bo... nie miałem takiej potrzeby - trudno mi więc powiedzieć czy przy godzinnym materiale nasyconym przejściami nie ma problemów, być nie powinno, ale kto wie.
Duża ilość efektów przy materiale 10 minutowym nie sprawia w każdym bądź razie problemów (duża ilość to u mnie 2 na minutę, to właściwie były same efekty, w którym przewijały się różne urywki filmowe, w sumie koszmar, ale to było dla jaj robione

). Godziny nigdy nie próbowałem, bo to byłby koszmar nie do wytrzymania, zresztą efektów by mi zabrakło
Ponad godzinne projekty także da się zrobić bez wywalania softu. Ja używam wersji 8.10.4.
Z tym renderingiem jeśli masz problemy to spróbuj sprawdzić czy nie masz problemów z miejscem na dyskach, bo o ile dobrze pamiętam przejścia podczas renderingu są tymczasowo składowane w innym folderze niż materiał docelowy i znowu o ile pamiętam jest to podkatalog w Moich dokumentach.